九寨沟县位于四川省北部高原，阿坝藏族羌族自治州东北部。东临甘肃省文县，北与甘肃省舟曲县、迭部县交界，西接若尔盖县南同平武县、松潘县接壤。地势西北、西南高，东南低，地貌类型以高山山原、高山峡谷和中山河谷为主 海拨1000-4500米，县城1400米。
